| 1 |  Filipe Duarte Sousa Cardoso (POR) | Barbot - Efapel | 10:53:13 |
| 2 | Samuel José Rodrigues Caldeira (POR) | CC Tavira | +9 |
| 3 |  Jon Aberasturi Izaga (ESP) | Orbea | +11 |
| 4 | Bruno Sandinha Saraiva (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +15 |
| 5 | Celestino Duarte Dias Pinho (POR) | | +17 |
| 6 | Luis Felipe Correia Afonso (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +17 |
| 7 |  Wilco Kelderman (P-B) | Rabobank Continental Team | +19 |
| 8 | Hugo Manuel Madeira Sabido (POR) | LA Aluminios - Antarte | +19 |
| 9 | Heldér Oliveira (POR) | Onda | +20 |
| 10 | Daniel José Mestre Pereira (POR) | CC Tavira | +21 |
| 11 | Delio Fernandez Cruz (ESP) | Onda | +22 |
| 12 | Salvador Guardiola Tora (ESP) | KTM - Murcia | +23 |
| 13 | Rafael Jorge Magalhães Silva (POR) | Liberty Seguros/sta. Maria Feira | +23 |
| 14 | José Antonio Carrasco Ramirez (ESP) | KTM - Murcia | +23 |
| 15 | Domingos André Maciel Gonçalves (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +23 |
| 16 | Sérgio Ferreira Sousa (POR) | Barbot - Efapel | +23 |
| 17 | Edgar Miguel Lemos Pinto (POR) | LA Aluminios - Antarte | +23 |
| 18 | Guilherme Lourenço (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +23 |
| 19 | Santiago Pérez Fernández (ESP) | Barbot - Efapel | +23 |
| 20 | Jaume Rovira Pous (ESP) | KTM - Murcia | +23 |
| 21 | Micael Isidoro (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +23 |
| 22 | Enrique Alonso Salgueiro (ESP) | | +23 |
| 23 | Adrian Saez De Arregi Egurrola (ESP) | Orbea | +23 |
| 24 | André Fernando Martins Cardoso (POR) | CC Tavira | +23 |
| 25 | Virgilio Martins Dos Santos (POR) | LA Aluminios - Antarte | +23 |
| 26 | Henrique Madeira Casimiro (POR) | CC Tavira | +23 |
| 27 | Alberto Morras Fernandez (ESP) | Onda | +23 |
| 28 | Hernâni Brôco (POR) | LA Aluminios - Antarte | +23 |
| 29 |  Joel Zangerle (LUX) | Differdange - Magic Sportfoot.de | +23 |
| 30 | Ricardo Jorge Correia Mestre (POR) | CC Tavira | +23 |
| 31 | Bob Jungels (LUX) | UC Dippach | +23 |
| 32 | Pit Schlechter (LUX) | LC Tétange | +23 |
| 33 | Oscar Garcia Casarrubios Pintor (ESP) | KTM - Murcia | +23 |
| 34 |  Kirill Baranov (RUS) | Itera - Katusha | +1:04 |
| 35 | Rafael Ferreira Reis (POR) | Bicicó | +1:05 |
| 36 | Bruno Manuel Sepulveda Borges (POR) | Onda | +1:05 |
| 37 | Alexei Tsatevitch (RUS) | Itera - Katusha | +1:07 |
| 38 | Javier Benitez Pomares (ESP) | KTM - Murcia | +1:19 |
| 39 | Marc Goos (P-B) | Rabobank Continental Team | +1:22 |
| 40 | Noel Martín Infante (ESP) | Orbea | +1:22 |
| 41 | Xabier Zabalo Imaz (ESP) | Orbea | +1:23 |
| 42 | Melvin Boskamp (P-B) | Rabobank Continental Team | +1:25 |
| 43 | Nick Van Der Lijke (P-B) | Rabobank Continental Team | +1:25 |
| 44 | Frederico Figueiredo (POR) | | +1:25 |
| 45 | Dimitry Ignatiev (RUS) | Itera - Katusha | +1:25 |
| 46 | Jon Pardo Abarzuza (ESP) | Onda | +1:25 |
| 47 | Viatcheslav Kuznetsov (RUS) | Itera - Katusha | +1:25 |
| 48 | Dmitry Mokrov (RUS) | Itera - Katusha | +1:25 |
| 49 | Tom Thill (LUX) | Differdange - Magic Sportfoot.de | +1:25 |
| 50 | Antonio Olmo Menacho (ESP) | | +1:25 |
| 51 | Christian Poos (LUX) | Differdange - Magic Sportfoot.de | +1:25 |
| 52 | Rui Miguel Sousa Barbosa (POR) | Barbot - Efapel | +1:25 |
| 53 | Benat Urain Epelde (ESP) | Orbea | +1:25 |
| 54 | Marcos Garcia Fernandez (ESP) | KTM - Murcia | +1:25 |
| 55 | Valter Pereira (POR) | | +1:25 |
| 56 | Sergio Miguel Vieira Ribeiro (POR) | Barbot - Efapel | +1:25 |
| 57 | Jesper Asselman (P-B) | Rabobank Continental Team | +1:25 |
| 58 | Nikita Novikov (RUS) | Itera - Katusha | +1:25 |
| 59 | Válter Coutinho (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +1:25 |
| 60 | Hugo Matos Sancho (POR) | LA Aluminios - Antarte | +1:25 |
| 61 |  Thomas Metcalfe (G-B) | CC Tavira | +1:25 |
| 62 | Hélder Fernandes Ferreira (POR) | Vitória/asc/rtl | +1:25 |
| 63 | André Mourato (POR) | | +1:41 |
| 64 | José Isidro Maciel Gonçalves (POR) | Liberty Seguros/sta. Maria Feira | +1:48 |
| 65 | Nuno Almeida (POR) | Bicicó | +1:53 |
| 66 | David Miguel Costa Rodrigues (POR) | | +2:10 |
| 67 | Igor Frolov (RUS) | Itera - Katusha | +2:35 |
| 68 | Victor Silva Valinho (POR) | Cartaxo/capital do Vinho/cc J. M. Nicolau | +3:16 |
| 69 | Nuno Meireles (POR) | | +3:22 |
| 70 | Sandro Filipe Silva Pinto (POR) | | +3:22 |
| 71 | David Da Silva Livramento (POR) | CC Tavira | +3:27 |
| 72 | Raúl Medín (ESP) | Gallega | +4:28 |
| 73 | Renato Alevar (POR) | | +4:28 |
| 74 | Antonio Ramírez (ESP) | | +4:28 |
| 75 | Flávio Gomes (POR) | | +4:28 |
| 76 | Kevin Kohlvelter (LUX) | | +4:28 |
| 77 | Héctor González Baeza (ESP) | KTM - Murcia | +5:23 |
| 78 | Carlos Miura (ESP) | | +5:55 |
| 79 | José Alberto Nocete (ESP) | Andalucia | +6:10 |
| 80 | Jóni Silva Brandão (POR) | Equipe Nationale du Portugal | +6:14 |
| 81 | Leonel Sousa Coutinho (POR) | Vitória/asc/rtl | +6:29 |
| 82 | Bruno Silva (POR) | LA Aluminios - Antarte | +6:29 |
| 83 | Oscar Riesebeek (P-B) | Rabobank Continental Team | +6:29 |
| 84 | Celio Cristiano Sousa Alves (POR) | Onda | +6:29 |
| 85 | João Mendonça Pereira (POR) | CC Tavira | +6:45 |
| 86 | João Cabreira (POR) | Onda | +7:15 |
| 87 | Rui Vinhas (POR) | LA Aluminios - Antarte | +7:31 |
| 88 | Fábio Andre Tomas Silvestre (POR) | Liberty Seguros/sta. Maria Feira | +8:12 |
| 89 | Filipe Silva Oliveira (POR) | | +8:12 |
| 90 | Pedro Duarte (POR) | | +8:12 |
| 91 | César Fonte (POR) | Barbot - Efapel | +8:15 |
| 92 | Rui Carvalho (POR) | Mortágua/basi | +9:14 |
| 93 | Fábio Costa (POR) | Mortágua/basi | +9:14 |
| 94 | Luis Filipe Silva Fernandes (POR) | | +9:25 |
| 95 | Pedro Fernandes (POR) | | +9:32 |
| 96 | Pedro Miguel Moreira Paulinho (POR) | Mortágua/basi | +9:58 |
| 97 | Aritz Etxebarria Etxebarria (ESP) | Orbea | +10:33 |
| 98 | Antonio Felipe Amorim Oliveira (POR) | Barbot - Efapel | +10:59 |
| 99 | Francisco Costa (POR) | | +12:32 |
| 100 | Jasper Bovenhuis (P-B) | Rabobank Continental Team | +13:11 |
| 101 | Joel Lucas (POR) | Louletano - Loulé Concelho | +14:43 |
| 102 | Samuel Magalhães (POR) | Vitória/asc/rtl | +15:17 |
| 103 | Jose Maria Alcaraz Franco (ESP) | KTM - Murcia | +15:39 |
| 104 | Aritz Bagües Kalparsoro (ESP) | Orbea | +16:16 |
| 105 | Carlos Baltazar (POR) | Barbot - Efapel | +16:43 |
| 106 | Ricardo Ferreira (POR) | | +16:50 |
| 107 | Mikel Bizkarra Etxeguibel (ESP) | Orbea | +20:10 |
| 108 | Eduardo Francisco García Martinez (ESP) | | +32:09 |
